La mediación entre iguales es una de las vías de solución a los conflictos que se utiliza en el Instituto. Se ofrece esta posibilidad cuando hay problemas interpersonales y, si los implicados están de acuerdo, se organiza una reunión  con la participación de personas mediadoras que facilitan la comunicación y la búsqueda de una solución al problema. Para ello cada grupo-clase cuenta con una persona mediadora cuya ayuda puede ser requerida por el orientador o por la Jefatura de Estudios.